例如，甲骨文和青铜器铭文只能部分破译，还有一小部分玛雅铭文尚未破译。 复活节岛的写作也很有名。 最著名的是印度河印文和克里特岛线形 A 文。
使用密码方法存在许多问题，首先是因为密码学通常已经知道代码是从已知脚本翻译而来的。
当然，还有很多其他的困难：
1.文字基本信息：
是文字吗？ （可能只是符号或图标。梧桐文字曾一度被认为不是文字）
完全是字面意思吗？ （或者只是类似于数字测量系统或音符的专门文本。最早出现的楔形文字是数字系统）
是拼音吗？ 音素表示（如英语）？ 音节语音（例如日语假名、行书 B）？ 辅音语音（如希伯来语，省略元音）？
或者表达一下你的感受？ 象形图？ 指的是某事？ 转喻？ 知道了？
一半表音一半表意？ （如埃及象形文字）
还有一些小问题，比如：写作方向？ 写字体？ 方言？ 外来词？ ETC。
2. 缺乏材料
即使使用计算机分析，前提是你必须有足够的文字材料传下来！
由于一些意外的火灾将粘土烧成陶器，线性 A 直到今天才被保存下来。 可想而知它的材料是多么稀缺。
梧桐文字的主要问题之一是句子通常太短！
目前破解的古文字大多都有一些我们所知道的相关语言，比如埃及象形文字、线形B（其实是不同文字系统书写的古希腊语）、楔形文字、玛雅文字等。
要完全破译一种符号未知、相关语言的传承或文字很少的未知语言，是非常困难的，甚至几乎是不可能的。
例如，一个小组正在尝试借助现代南印度语言破译印度河文字，并且似乎已经取得了一些进展。
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